شن تنظيم " داعش"  أو ما يعرف ب "الدولة الإسلامية في العراق والشام" هجومًا عنيفًا على بعض الشيوخ المغاربة وعلى رأسهم عمر الحدوشي، الذي أفرد له التنظيم شريطًا مصورًا خاصًا باعتباره أحد الطاعنين في الدولة الإسلامية، حمل عنوان "حقيقة مخالفي الدولة الإسلامية.. الحدوشي نموذجًا".وسبق للحدوشي أن انتقد فكر" داعش" ناشرًا على صفحته في تويتر " ابتلينا بأناس يكفرون بالجملة بسبب جهلهم المركب،هؤلاء أفسدوا الجهاد مع مسلمي الثورة".وقال الحدوشي إن "أصول الخلاف مع الدولة الإسلامية خمسة أمور: التكفير بغير حق، والقتل بغير حق، والكذب والجهل وعدم مراعاة السياسة الشرعية في العمل الجهادي".ومن مواقفه أيضًا رفضه لهجرة بعض المغاربة للقتال في سورية تاركين ورءهم ديونًا وأطفالًا ونساءًفأغضبت هذه التغريدات "داعش" فردوا بشريط فيديو بالقول" لا بارك الله فيك لا أنت جاهدت ولا تركت الناس تجاهد ولا خلفتهم في أهليهم خيرًا". منتقدين إياه على موقفه الداعي إلى نصرة حركة النهضة في تونس"حتى ولو أخطأت لأنها مأجورة على ذلك أيضًا ولم يسلم مرشد ومؤسس جماعة العدل والإحسان، الراحل عبد السلام ياسين، من تهجم "داعش"